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五氯苯酚暴露致花鲈Lateolabraxjaponicus肝脏损伤的转录 ...
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[天文地球]
五氯苯酚暴露致花鲈Lateolabraxjaponicus肝脏损伤的转录组分析
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admin
发表于 2024-12-3 22:04
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五氯苯酚暴露致花鲈Lateolabraxjaponicus肝脏损伤的转录组分析.pdf
为了探明五氯苯酚暴露后花鲈肝脏的损伤变化,本文利用IlluminaHiSeqTM2000测序技术对不同浓度五氯苯酚(0μg/L、0.1μ上g/L、1.0μg/L、10.0μg/L、100μg/L)暴露后花鲈肝脏组织进行了转录组测序.经Trinity软件拼接,得到cleanreads共247914284条,获得53716条基因.对照不同浓度暴露组和对照组的转录组测序结果,获得共有的差异性表达基因135个,特异性的差异基因数分别有127~819个不等,差异蛋白表达数量随着受试浓度的升高而上升.经BLAST搜索,其中有21459、26464、18896、12403、17262和19159条分别注释到Swiss-prot、Nr、Pfam、KEGG、KOG和GO数据库.KEGG代谢通路分析结果显示获得的差异基因分别映射到6大类141条通路,这些差异表达基因在与环境信息进程相关的信号传导和与组织系统相关的免疫系统的通路中富集最多.总体来看,在受到五氯苯酚类物质胁迫后,花鲈体内的信号传导系统首先发生响应,导致机体出现紊乱.污染物暴露后,花鲈机体的应对机制尚待深入分析.
作者:郑丹 焦海峰 严小军 张乐 阮松林
作者单位:宁波大学海洋学院宁波315211;宁波市海洋与渔业研究院宁波315010宁波市海洋与渔业研究院宁波315010宁波大学海洋学院宁波315211杭州市农业科学研究院杭州310021
母体文献:宁波市第十届学术大会论文集
会议名称:宁波市第十届学术大会
会议时间:2018年10月1日
会议地点:宁波
主办单位:宁波市科协
语种:chi
分类号:R73S96
关键词:花鲈 肝脏损伤 转录组分析 五氯苯酚暴露
在线出版日期:2021年8月24日
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2024-12-3 22:04 上传
五氯苯酚暴露致花鲈Lateolabraxjaponicus肝脏损伤的转录组分析.pdf
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五氯
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苯酚
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致花
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Lateolabraxjaponicus
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